雷雨行动无疑触动了许多人，何大来连夜打来电话斥责林荫，要他立刻放了陶素素和郑华军。林荫正在对付何大来，洪市长、陈副市长、和于海荣也找上门来。他们是来转达万书记的指示，说公安局的行动，吓跑了外商损害了经济建设。对皇朝大酒楼的违法行为，罚款就行，人必须放了。林荫不服，争辩，不同意放人。这时谷局长来了电话，也让林荫放人，林荫不相信。谷局长告诉林荫，他不希望林荫是个短命局长。林荫把郑华军的罪行说了，谷局长同意郑华军可以先不放，但陶素素要放。林荫心中一片茫然。秀云也劝他快放人，别把领导得罪了。林荫冲她发起火，秀云深感委屈……

　　黄建强、秦志剑等人来汇报处理情况，同时安慰林荫，说雷雨行动能进行到这一步，已经很不错了，对放人表示理解。林荫问他们陶素素究竟是什么人，秦、黄说出陶的一段身世……

　　人们离去，天已渐亮。秀云还在为刚才林荫对他发火而伤心落泪，林荫只得耐心劝慰，才让秀云破涕为笑。

　　“雷雨行动”在社会上产生了很大的反响，黄建强接到匿名电话，那人说自己是刘正案的目击者，说砍人的歹徒中就有郑光军兄弟的手下贺刚和刀疤，可以肯定背后指使者就是郑光军兄弟，只要这次公安局惩处郑华军，他就敢出来作证。林荫决定尽快将郑华军押往南方重新做精神病鉴定。

　　秀云要返回白山家中，郝正擅自派车将她送回，违反了公车不得私用的规定。而这规定恰恰是林荫来后制定的。郝正又给秀云留下两千元钱。林荫得知郝正的举动后，十分恼火，把郝正找来，批评了他并将钱还给他。郝正很尴尬，认为林荫是不识抬举，是嫌钱少，开始怨恨林荫。

　　郑光军对万书记说林荫清查皇朝大酒楼是和他对着干，挑唆万书记尽快将林荫整下去，放出郑华军。万书记却显得为难，责怪郑华军是咎由自取……

　　雷雨行动后，牛明躲进医院。郑光军来看他，劝他不能躺倒不干，还应回局里替他们发挥作用。牛明一出院，便向罗厚平了解对郑华军的处理动向……

　　罗厚平和两个刑警押着郑华军来到一个小火车站，准备登车南下，突然出现七八个暴徒，劫持郑华军逃跑。

　　林荫命秦志剑和罗厚平迅速展开追捕，但进展不大。方政委建议调整追捕方案，同时提醒林荫万书记对清查皇朝大酒店是极为不满的，从今后工作着想，最后主动向万书记汇报，争取共识。但出乎意料，万书记似乎对他们的汇报不感兴趣，以没有时间为由冷淡地拒绝了，这令林、方觉得他是另有所图……

　　地区公安局召开工作会议，会上谷局长表扬了清水公安工作的改进，何大来则批评清水法案上升。谷局长指出发案上升的原因是林荫将前任隐瞒的案件重新立案，值得肯定，令何大来十分尴尬。谷局长布署下阶段工作重点，一是继续打黑，二是搞好各局的人事制度改革。会后，谷局长让林荫回家看看。

　　林荫回到久别的家中，意外地看到侄子大明。交谈中，林荫得知大明是想通过他进公安局工作，秀云也替大明说话。林荫深感为难，他歉疚地告诉大明，这个事他做不到，局里马上就要开始改革人事制度了，自己要做出表率。大明不服气。父亲却支持林荫，要大明理解他。

　　赵铁军被停职后，跑到铁锋镇个体铁矿老板范大成手下当护矿队队长，这天，三位辽宁刑警来到铁峰镇，追缴一辆赃车。这辆赃车正是范大成的座车，范大成不仅不交出赃车，还召来赵铁军等护矿队员，将辽宁刑警和当地民警打伤。

　　林荫赶到铁峰镇查处此事，深入追查之下，才知此事还牵涉到交警大队的一个副股长，是他给赃车入的户。林荫不禁质问道：像赵铁军这样的人全局还有多少?靳树林说这是普遍问题，必须采取治本措施。林荫意识到治本措施就是进行人事制度改革。实行聘任聘用制度，竞争上岗，优胜劣汰，要尽快着手制定改革方案。

　　为减少阻力，局党委会前，林荫先了解各方态度。方政委并没有林荫预想的那么积极，只是说可以搞但可能效果不佳，因为两年前就搞过聘任制。林荫表示上次没达到目的，这次要动真格的，上级还要求先行一步。方政委淡淡一笑，表示这个头可不好带，再怎么改，党管干部的原则不能丢。林荫对方政委的态度感到不解。林荫又征求秦志剑等科所室领导和民警们的意见，他们的反应却比较积极，秦志剑还谈了上次改革失败的问题，认为群众意见群众投票一定要算数，否则这次改革又是空忙一场。但也有人忧心忡忡，怕搞竞聘上岗，自己会落选，比如郝正，到处探听情况，揣摩别人的态度。

　　在讨论改革方案时，牛明以党管干部为理由，反对以群众投票为聘任依据。靳树林也附和，说投票只能参考，最终还得党委说了算。方政委则模棱两可，老靳却支持林荫。林荫找方政委交谈，方政委依然顾虑重重。

　　牛明因在党委会上靳树林赞同他的意见，高兴地拉靳树林喝酒。牛明酒后吐真言，要靳树林和他抱成团，与林荫对着干，只要不对他们的心思，就让他滚蛋。靳树林反倒被这话吓醒了，他想自己的想法跟牛明可不一样，不能跟着他跑，应该主动找林荫谈。靳树林对林荫谈出自己的担心：如果完全以民警投票为准，那么就有可能将平时没本事工作能力差，却擅长搞关系的人选上来，这反而对工作不利。林荫听后觉得有理，两人又一起商量出一个合理的民主测评的方法。林荫又从靳树林口中得知，方政委除了工作上的顾虑外，也怕儿子方文下岗。林荫豁然开朗，自责自己没能设身处地为方政委考虑，但改革又是势在必行，他迫切要与方政委再谈一次。

　　牛明又拉方政委喝茶，先夸方政委的消极态度是对的，接着便挑拨说林荫的做法，就是不把党委和他这个政委放在眼里，表示自己今后一切听方政委的，与林荫对着干。听了这话，方政委突然觉得自己会被牛明等人当枪使。他立刻打电话约林荫面谈。方政委坦诚告诉林荫，自己确实有私心，但还是共产党员，还没有堕落，完全支持林荫。

　　改革方案在公安局开始实施，竞聘中层领导岗位的人，积极准备，气氛十分热烈。却有少数人惶惶不安，郝正对办公室主任的位子垂涎已久，到处试探人们的看法……