一九三一年三月，日本驻哈尔滨生化武器研究小组成员龟井寿不慎感染了鼠疫，由于害怕遭到杀害，他悄悄地逃了出来。

　　日本黑龙会驻哈分会会长内田武岩，为防止日本秘密研究生化武器的事情败露，命令特别行动组组长山口良雄率人马上追杀龟井，并在哈尔滨市立医院内将龟井截住，就在山口准备将龟井杀死时，被守备旅上尉军医冷风及其弟冷动制止，山口从手下口中得知，冷风与冷动为哈尔滨商会会长冷春秋的儿子，于是不敢正面发冲突，只得藏在医院内，暗中寻找下手时机。

　　冷风经过对龟井的检查发现其已染上鼠疫，于是迅速将情汇报给了守备旅旅长张大炮，并要求张及时向少帅张学良汇报，以及进行全城检查。

　　张大炮与市长钱秉文由于害怕贪污防疫专款的事情败露，拒绝了冷风的请求，无奈的冷风只得向好友，时任守备旅警备队队长的七条寻求帮助，七条决定协助冷风将事情汇报给张学良。

　　山口趁冷风离开之时，将龟井及接触过龟井的医生杀害，就在他准备将龟井的尸体带回时，冷风返回了医院，山口只得无奈的离开。

　　冷风发现龟井及医生遇害，感到事情的严重，于是一方面将龟井的尸体转移，准备进行解剖，另一方面请求七条派兵来医院戒备。内田见山口没有带回龟井的尸体很是生气，命令山口马上去医院抢回尸体。就在山口来到医院寻找尸体时，七条也带兵赶到，双方发生激烈的交火。

　　七条将山口从医院中击退，将冷风从被困的手术室中救了出来，但冷风的助手姚玲不幸被流弹击中，所幸被门板所挡，没有生命危险。

　　守备旅在医院发生枪战的消息很快传遍哈尔滨的大街小巷，张大炮率人马上赶到医院，同时冷春秋担心冷风出现意外，带人也来到了医院。

风雷动剧照

　　冷风的媳妇喜妞在院看见冷风正在为姚玲疗伤，醋意大生，与冷风发生争吵。返回黑龙会的山口被内田大加训斥，因为与守备旅的正面冲突，已导致冷家对日本人施行了经济制裁，使得日本在哈尔滨的侨民日常生活陷入困境。

　　内田来到冷家，想与冷春秋讲和，但被拒绝。冷风与七条分析后认为龟井有可能是从下水道中逃出，所以派兵对全市的马葫芦盖进行检查，希望能找到龟井逃出时留下的线索，以便能够追查到鼠疫的来源。

　　与此同时苏联也发现哈尔滨出现鼠疫的情况，为了了解是否为日本的生化武器专家坂稻一所为，他们派出了一个有着东方面孔的特工来到了哈尔滨。

　　冷风独自一人来到市立医院附近的街道搜查，遭到山口的偷袭，被前来找冷风的冷动等人赶跑，原来冷动在哈尔滨有一个建筑公司，刚刚从苏联聘请了一位名叫科恩的建筑师，由于冷动不懂俄语，所以前来找冷风陪同到火车站接站。

　　火车上日本特务稚子将科恩杀害，并故意与苏联派来的特工何三关坐到了一起。

　　冷风与冷动来到车站，与冒名科恩米拉的稚子和何三关一番寒喧后，将冒充科恩的稚子接回马迭尔旅馆，山口也悄悄的尾随赶到。

　　稚子为防止坂本稻一实验室位置暴露，命令山口把通往实验室的线索掩盖掉。

　　何三关来到苏联驻哈的情报机关，让情报员瓦西里帮助调查稚子的真实身份，并决定从冷家开始调查鼠疫的事情。由于冷家的经济封锁，使得坂本的实验器材运不进来，这让内田很是着急，决定再次前往冷家，与冷春秋讲和。

　　冷风来到守备旅，向张大炮索要交火当天交给七条的皮箱，因为里面装有龟井尸体切片，对调查鼠疫有着至关重要的意义，但是张大炮却谎称皮箱已被自己销毁，冷风只得无奈的离开。

　　黑龙会内张大炮手下林副官将皮箱交给了内田，并把从内田那里得到的酬金交到了张大炮手上。

　　冷风又气又恨的回到医疗所，对七条大发雷霆，斥责他不应该把这么重要的东西交给张大炮，七条听后不知所措，冷风突然想起自己在医院附近的下水道口被山口偷袭，于是七条决定先带人过去调查，让冷风先回家，安顿好后再去。

　　内田来到冷家，对冷春秋软硬兼施，但丝毫不起作用，反被冷春秋骂得无地自容，赶了出来。

　　七条来到下水道口处，遇到了正在销毁证据的日本特务，七条用计将对方打死，并立刻派兵去冷家找冷风，自己则率兵进入下水道调查。何三关回到人以寓，从怀中掏出冷家所有人的照片，似乎他与冷家之间有着一种难以言表联系。

　　刚刚到家的冷风被赶来的士兵叫走，七条在下水道中发现了一处被人刚用水泥封住的管道口，于是命令士兵把水泥砸下来，不料声音太大，惊动上面的日本人，坂本稻一让山口找来了煤气罐，向下水道中施放，士兵由于煤气中毒都没了力气，七条不明原因，以为手下偷懒，于是让他们回井口把守，自己一个继续挖墙。

　　何三关乔装潜入冷家，将一幅写有“关帝显圣，血债血还”八个字的关公画像，挂到了大厅里，随后赶到的冷府管家李忠信看到后，吓的瘫倒在地。